Trong các ngành khoa học tự nhiên, học viện tài trợ kinh phí các dự án về địa chất học, hệ động thực vật của Israel, và tạo điều kiện cho sự tham gia của các nhà khoa học Israel nghiên cứu các dự án quốc tế, chẳng hạn như vật lý năng lượng cao tại CERN) và bức xạ synchrotron tại cơ sở bức xạ synchrotron châu Âu[3]. Israel có mật độ các nhà khoa học và kỹ sư cao nhất trên thế giới [cần dẫn nguồn]).

Trong ngành khoa học nhân văn, các lĩnh vực nghiên cứu được tài trợ gồm có nghiên cứu Tanakh và Talmud, lịch sử người Do Thái, triết học Do Thái, nghệ thuật người Do Thái, và tiếng Do Thái, cũng như thơ văn xuôi và thơ tiếng Do Thái.Học viện quản lý quỹ học bổng Einstein, quỹ để thúc đẩy mối quan hệ giữa các nhà khoa học từ khắp nơi trên thế giới và các cộng đồng học thuật Israel, quỹ khoa học Israel, với một ngân sách hàng năm là 53 triệu USD, và số một quỹ nghiên cứu dựa trên các tài trợ từ quỹ Adler cho nghiên cứu vũ trụ, quỹ Wolf, và quỹ nghiên cứu y học Fulks. Học viện cũng quản lý trung tâm học thuật Israel tại Cairo, giúp các học giả Israel với nghiên cứu về Ai Cập và văn hóa Ai Cập, và tạo điều kiện hợp tác với các học giả Ai Cập.